Windows-rekisterissä on HKEY_LOCAL_MACHINE- tai HKLM-tunnus . HKLM-juuriavain sisältää asetukset, jotka liittyvät paikalliseen tietokoneeseen. Microsoft Windows XP: ssä ja aikaisemmin HKLM: ssä on neljä pääaluetta: SAM, SECURITY, SOFTWARE, SYSTEM . On myös viides avain, nimeltään HARDWARE, joka luodaan lennossa ja jota ei tallenneta rekisteritiedostoon. Windows Vistassa ja 7: ssä on kuudes alakoodi, joka on nimeltään BCD.

OHJELMISTO-aliavain on yleisimmin käytettävä rekisteriavain, koska se sisältää Windowsin ja tietokoneeseen asennettujen ohjelmien asetukset. Kun ohjelmisto on asennettu, tiedot kirjoitetaan SOFTWARE-aliavainta sovelluskohtaisia ​​asetuksia varten. Nämä asetukset ladataan tietokoneen muistiin joka kerta, kun käyttöjärjestelmä käynnistyy, jolloin käyttäjän lataamana ohjelma ei tarvitse määrittää ohjelmaa uudelleen.

Ohjelmiston ehdot, Windowsin rekisteri