Karantiini on eräiden virustentorjuntaohjelmien tekemä toimenpide. Kun tiedosto (kuten haittaohjelma tai virus) on karanteenissa, tiedosto siirretään levylle, jossa sitä ei voi suorittaa. Käyttäjien, jotka ovat kiinnostuneita tartunnan saaneen tiedoston sisällöstä tai tiedoista, tulisi tartuttaa tartunnan saaneeseen tiedostoon, joten kaikilla tärkeillä tiedoilla on mahdollisuus saada takaisin.

Virus- tai tartunnan saaneen datatiedoston voi olla tarpeen karanteeniin, jos sitä ei voi poistaa tai puhdistaa. Tässä tapauksessa karanteenitiedosto siirretään paikkaan, jossa se ei voi tartuttaa muuta tietokonetta, suojaamalla järjestelmää, vaikka tiedostoa ei voi puhdistaa tai poistaa.

Suojausehdot